Omega-3PUFA抑制大肠癌细胞株转移差异基因表达的筛选

摘要

目的流行病学调查认为Omega-3多不饱和脂肪酸(Omega-3 PUFA)与大肠癌的发病率呈负相关,但具体机制仍不明确。本文研究Omega-3 PUFA抑制大肠癌转移的差异基因并通过实时PCR验证。方法采用MTT法检测Omega-3 PUFA对大肠癌细胞株活力的影响,确定最佳浓度及时间,采用Illumina公司开发的人全基因组表达谱芯片,检测差异基因,运用Real-time PCR验证候选差异基因。结果Omega-3 PUFA抑制HCT116细胞的活力作用,以30μg/ml及48 h时段最明显,OD值为0.42,抑制率为53.78%;Omega-3 PUFA抑制SW480细胞的活力作用,以30μg/ml及48 h时段最明显,OD值为0.29,抑制率为71.01%。从实验组和对照组2株大肠癌细胞中交集出61个共同差异基因,结合文献,与转移有关基因只有COL11A2(下调基因),下调倍数为4~5倍。Real-time PCR验证候选差异基因与基因芯片结果一致。结论Omega-3 PUFA抑制大肠癌的转移,与COL11A2基因有关联。