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基于TCGA和GEO数据库探讨VCAN基因及其甲基化在胃癌预后判断中的价值

     

摘要

目的探讨多功能蛋白聚糖基因(VCAN基因)表达和甲基化在胃癌患者预后判断中的价值。方法通过生物信息学方法分析、研究了VCAN基因的表达及甲基化水平,以及其在预后和免疫方面的意义。此外,通过Meta分析验证VCAN基因在胃癌预后判断中的作用。结果VCAN基因受到甲基化的负调控,导致其在胃癌组织中高表达。根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库,VCAN基因表达和甲基化水平均与胃癌患者的总生存率(OS)和无进展生存率(PFS)有关。Meta分析显示,VCAN基因低表达与较高的生存率密切相关。VCAN基因的表达与某些免疫细胞或分子密切相关,尤其是CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、CD2、CD3D和CD3E。结论VCAN基因在胃癌免疫细胞的浸润中起着重要作用,并可作为一个潜在的胃癌预后生物标志物。

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