绵羊IGFBP-7基因的克隆及序列分析

摘要

试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列.结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99％、95％、90％,氨基酸序列同源性分别为98％、93％、89％,GenBank登录号为FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基酸分子质量为29.0 ku,理论等电点(pI)为8.25;进化分析显示其与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与斑马鱼、鲍等亲缘关系较远;IGFBP-7基因的蛋白质疏水性区域与亲水性区域间隔较为均匀分布,有1个信号肽、2个跨膜区、16个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和B-折叠区域分别为64.89％、19.86％、15.25％;三级结构分析显示存在IGFBP N和Ig-like功能域.该试验为进一步研究绵羊IGFBP-7基因的功能奠定了基础.