趋化因子及其受体家族分子适应性进化分析

摘要

Branch-Site模型是检测基因序列中单个密码子位点是否具有选择作用的统计学方法.该模型能有效地检测基因在进化历程中是否受到选择作用,并预测出那些在进化过程中对功能分化有重要贡献的、受正选择作用的密码子位点.趋化因子是一类控制免疫细胞定向迁移的细胞因子,其功能行使由趋化因子受体介导.该文用Branch-Site模型分析趋化因子及其受体基因家族的分子适应性,发现只有少数种类基因受到正选择作用,如RANTES、CCR5等.并预测出一些可能受到正选择作用的位点,蛋白3D分析显示,它们均位于趋化因子和相应受体相互作用的结构区域.