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鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析

         

摘要

miR-17-92基因簇(miR-17-92 cluster)在细胞增殖、分化、凋亡、动物发育以及肿瘤发生等过程中发挥重要作用.目前,人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇的转录调控已有深入研究,但该基因簇在鸡等鸟类中的转录调控研究还未见报道,主要原因在于鸟类miR-17-92基因簇上游的基因组序列都存在一个gap,且该基因簇启动子的位置和序列也还不清楚.为此,本研究采用染色体步移的方法获得鸡miR-17-92基因簇上游gap区序列,并采用生物信息学分析和报告基因及截短突变技术开展该gap区的功能分析.染色体步移分析发现,鸡miR-17-92基因簇上游gap区全长1704 bp,GC含量达80.11%.生物信息学分析显示,鸡miR-17-92基因簇上游gap区内1段200 bp的序列与人、牛、小鼠等9种动物miR-17-92基因簇上游序列保守性较高,且该区域为人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇宿主基因的核心启动子区.将克隆的gap区序列插入pGL3 basic荧光素酶报告基因载体,构建成启动子荧光素酶报告基因载体pGL3-cMIR 17HG(-4228/-2506).荧光素酶报告基因活性分析表明,pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)报告基因的活性是pGL3 basic空载体活性的417倍,证明所克隆的gap区片段是鸡miR-17-92基因簇宿主基因的启动子.为进一步分析该启动子的结构和功能,构建gap区片段的5'端缺失突变(缺失448 bp)和3'端缺失突变(缺失894 bp)的荧光素酶报告基因载体.与pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)相比,5'端和3'端缺失突变分别使启动子报告基因活性降低19.82%和60.14%.这些数据提示,鸡miR-17-92基因簇宿主基因启动子的重要调控区位于-3400/-2506.本研究结果为进一步开展鸡miR-17-92基因簇的转录调控奠定了基础.

著录项

  • 来源
    《遗传》 |2016年第8期|724-735|共12页
  • 作者单位

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

    农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨150030;

    黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨150030;

    东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    鸡; miR-17-92基因簇; 启动子; 转录调控;

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