基于数据挖掘分析ZC3H13在透明细胞肾细胞癌中的表达及预后意义

摘要

目的 分析ZC3H13在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义.方法 利用Ualcan和GEPIA数据库分析并验证ZC3H13 mRNA在ccRCC中的表达及其与临床病理指标和生存期的关系,对ZC3H13基因进行共表达分析及相关性分析.利用人类蛋白质图谱(HPA)数据库中的细胞系及免疫组化结果分析ZC3H13蛋白在ccRCC中的定位及表达情况.利用STRING在线分析以ZC3H13为中心相关蛋白之间的相互作用.结果 Ualcan数据库结果显示,在ccRCC、乳头状肾细胞癌(PRCC)、嫌色细胞肾细胞癌(CRCC)中,ZC3H13 mRNA表达水平均下调(P<0,05).GEPIA数据库结果显示,相比于正常肾组织,ZC3H13 mRNA在ccRCC、PRCC、CRCC这3种亚型肾细胞癌中表达水平均下调(P<0,05).Ualcan数据库结果显示:Ⅰ期ccRCC患者ZC3H13 mRNA表达水平高于Ⅲ期者(P<0,05);与ccA型比较,ccB型ccRCC患者的ZC3H13 mRNA表达水平较低(P<0,05);ccRCC患者的组织学分级与ZC3H13 mRNA的表达水平有关,相比于低组织学分级患者,具有高组织学分级的患者ZC3H13 mRNA的表达水平更低(P<0,05).在GEPIA数据库中,随着ccRCC肿瘤分期的升高,ZC3H13 mRNA的表达量逐渐下降(P<0,05).Ualcan数据库挖掘性分析发现,在ccRCC中,与ZC3H13 mRNA高表达组比较,ZC3H13 mRNA低表达组生存期较短(P<0,05).GEPIA验证性分析发现,在ccRCC中,与ZC3H13 mRNA高表达组比较,ZC3H13 mRNA低表达组的总生存期和无瘤生存期下降(P<0,05).HPA数据库结果显示,在A-431肿瘤细胞系中,ZC3H13主要定位于核膜和肌动蛋白丝.利用免疫组化抗体分析显示,ZC3H13蛋白主要表现为细胞核着色,部分胞质轻微着色.ZC3H13与VHL、PBRM1、mTOR、HIF-1α等ccRCC多种关键基因呈正相关(P<0,05).STRING在线分析显示,ZC3H13与WTAP、POLR2B、KIAA1429等基因共同参与RNA修饰与代谢、RNA甲基化等生物学过程.结论 ZC3H13在ccRCC中低表达,与肿瘤恶性生物学行为和不良预后相关.ZC3H13与VHL、PBRM1、mTOR、HIF-1α等ccRCC发生、发展及预后进程中的重要基因存在一定联系,有望成为评估ccRCC预后和指导治疗的新型分子标志物.