西洋梨全基因组bZIP基因家族生物信息学分析

摘要

碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP),是广泛存在于真核生物中的保守转录因子,其在植物生长过程中参与重要的调控作用.为了解西洋梨bZIP基因家族相关信息,本研究利用生物信息学的方法,在全基因组水平鉴定并分析了西洋梨bZIP基因家族.结果表明,共鉴定出52个PcbZIP基因,系统进化将其分为9个亚族(A、B、C、E、F、G、H、I和S),PcbZIPs中外显子的个数从1?10个不等,PcbZIP转录因子的氨基酸数目在122?741个,等电点在5.42?10.41,PcbZIP基因都定位在细胞核上.基因定位显示,52个PcbZIP基因不均匀地分布在17条染色体上.本研究对西洋梨bZIP家族基因的鉴定与分析,为进一步开展西洋梨bZ-IP基因的挖掘与功能验证提供依据.