慢性牙周炎患者龈下菌斑宏转录组菌种分类以及相关代谢基因表达

摘要

目的 分析慢性牙周炎患者龈下菌斑宏转录组,探究慢性牙周炎新的发病机制.方法 选取航空总医院口腔诊疗中心2015年3月至2016年12月收集的20例慢性牙周炎患者为观察对象,采集龈下菌斑提取其中RNA,应用高通量的二代测序技术,对其宏转录组进行分析,观察慢性牙周炎发生、发展过程中明显与之相关的基因表达情况.结果 慢性牙周炎患者的龈下菌斑中主要细菌共7种,占细菌总量的28.1％,其中文氏密螺旋体占12.4％、齿垢螺旋体占3.6％、牙龈二氧化碳噬纤维菌占2.8％、牙髓卟啉单胞菌占2.6％、普雷沃菌占2.6％、梅毒螺旋体占2.1％、中间普氏菌占2.0％,而螺旋体含量最高,为18.1％;与牙周炎发生关系密切的同源蛋白质家族中,最多的表达基因序列与细菌的翻译相关超过5000条;数量最多的基因数量集中于精氨酸、脯氨酸代谢通路上,有1149条与之相关;而碳水化合物活性酶相关的基因表达中,表达最多的是碳水化合物相关结构域基因序列和糖苷水解酶基因序列多达43以及34,多糖裂解酶表达为0.结论 慢性牙周炎龈下菌斑中,螺旋体的基因序列高度表达.细菌感染机体后,细菌翻译活动占了主要作用,对于对细菌生长代谢起主导作用的碳水化合物的利用上,细菌则表现出对于普通的单糖、双糖相较于多糖更多的基因表达.