供体细胞系基因座位特异DNA甲基化多态性及其与猪克隆效率的关联分析

摘要

利用甲基化限制性酶切试验(Combined bisulfite restriction analysis,COBRA)和亚硫酸盐转换PCR(Bisulfite sequencing PCR,BSP)后测序的方法,筛选猪体细胞克隆优势供体细胞提供基因座位特异的DNA甲基化遗传标记.比较8个发育重要基因的差异甲基化区域(Differentially methylated regions,DMRs)在不同克隆供体细胞系中的DNA甲基化多态性,并与猪克隆成绩进行关联分析.结果表明:除了XIST-DMR2和H19-DMR3 DNA甲基化变异幅度较小(低于10％)外,其他基因的相关座位均存在一定的COBRA多态性,其中,LINE 1-DMR1、POU5F1-DMR1和NANOG-DMR1等3个差异甲基化化区域在克隆效率最高细胞系中处均处于最低程度的DNA甲基化状态,因此,可作为筛选猪体细胞克隆优势供体细胞系的潜在的DNA甲基化遗传标记.