基于Cytb和D-Loop基因对中国少鳞鳜种群遗传多样性的分析

摘要

为探究贵州省中国少鳞鳜野生资源多样性状况,利用线粒体DNA Cytb基因和D-Loop基因分析评价沅江上游铜仁锦江、平塘县平舟河及荔波县樟江3个自然群体的86尾中国少鳞鳜的遗传多样性、遗传结构及种群历史动态.测序结果表明,中国少鳞鳜Cytb基因的序列长度为1141 bp,D-Loop为822 bp.在Cytb区段共检测出11个变异位点,界定了18种单倍型,3个群体平均的单倍型多样性、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性分别为0.918、3.342和0.00293;在D-Loop区段中共检测出17个变异位点,其中有3个缺失和2个插入,界定了23种单倍型,3个群体平均的单倍型多样性、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性分别为0.903、3.343和0.00410.遗传分化指数显示出3个群体间存在极大的遗传分化;中性检验和核苷酸不配对分布分析表明,本试验的中国少鳞鳜未经历过种群扩张.中国少鳞鳜属迁徙能力弱、较封闭的小群体,因近交衰退效应,种群结构较为原始,长江流域群体生境理想,进化潜力较大.荔波樟江种群面临生存危机,而锦江更适宜中国少鳞鳜栖息繁育.本试验从分子水平评价贵州省中国少鳞鳜遗传多样性水平,将为其种质资源的保护和开发利用提供依据.