2018年深圳市学校结核病临床分离株的MIRU-VNTR基因分型及传播特点分析

摘要

目的应用可变数目串联重复序列(variable-number tandem repeat,VNTR)基因分型技术对学校结核病的流行情况进行监测,了解2018年深圳市学校结核病临床分离株的基因多态性及近期传播情况。方法收集深圳市慢性病防治机构及定点医院学校结核病患者培养阳性菌株,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对12个MIRU-VNTRs位点进行检测。检测结果采用MIRU-VNTRs在线分析软件和MEGA7.6软件进行基因分型、聚类分析和进化树图绘制。结果2018年深圳市慢性病防治中心共收集63例学校结核分枝杆菌培养阳性菌株,其中有来自学生患者的菌株52例(82.5%),教职工患者菌株11例(17.5%)。学生结核病主要发生在高中/职高(44.23%)和大学(40.38%),而教职工结核病主要发生在幼儿园(54.5%)。63株结核分枝杆菌分为59个基因型,包括56个独特基因型,3个基因簇;其中北京基因型菌株43株(68.3%),非北京基因型17株(27.0%)。在3所学校内均发现2例患者感染结核分枝杆菌株的案例,流行病学调查结果分别判断为独立感染、校内传播和家庭聚集性疫情。结论2018年深圳市学校结核病临床分离株基因型多样性高,未出现2例以上的聚集性疫情,学校结核疫情的防控状态现状良好,MIRU-VNTRs同源性鉴定技术可应用于聚集性群体结核病分子流行病学调查的常规监测和应急检测。