日本对虾(Marsupenaeys japonicus)HsP70基因cDNA的克隆与序列分析

摘要

根据中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)Hsp70的cDNA序列及日本对虾(Marsupenaeus japonicus)Hsp70 cDNA序列片段设计引物,用RT-PCR方法,从经热休克处理的日本对虾鳃总RNA中克隆到长1992 bp的Hsp70 cDNA序列,包括长1959 bp的完整编码序列(CDS).根据编码序列推导出相应的652个氨基酸,与其他真核生物Hsp70家族成员进行同源性比较,发现与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、斑节对虾(Pinaeus monodon Fabricius)、中国明对虾(Penaeus chinesis)的相似度分别为99.5%、99.4%、99.4%,与日本沼虾(Macrobrachium nipponense)和罗氏沼虾(M.rosenbergii)的相似度分别为93.7%和92.9%,与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、原鸡(Callus gallus)、家鼠(Mus musculus)和人(Homo sapiens)的相似度为89.2%、85.4%、88.3%和88.3%,表现出较高的保守性.分析表明所得到的日本对虾Hsp70是一种Dnak亚家族类型的细胞质Hsp70,拥有完整的N端ATP酶结构域(约45 kDa)、底物肽结合结构域(18 kDa)及C端结构域(10 kDa).以上结果说明我们所得到的序列是一条包含完整CDS的Hsp70基因序列.