利用相关性分析鉴定与水稻根部性状表达相关的分子标记

摘要

8 4个水稻品种在营养液中生长 ,10天后测定每一品种的最大根长 (MaximumRootLength ,MRL)和根干重 (RootDryWeight,RDW )。选取其中有代表性的 2 7个水稻品种 ,用扩增片段长度多态性 (AmplifiedFragmentLengthPolymorphism ,AFLP)技术进行基因组差异分析 ,通过计算差异带与性状表现间的相关系数 ,筛选与苗期水稻最大根长和根干重显著相关的分子标记。经过 15对AFLP引物的筛选 ,有 4对引物的 7个片段的基因型表现与最大根长或 (和 )根干重显著相关。对其中的片段之一“T3P3f”进行克隆、测序后 ,设计特异PCR扩增引物“Z336” ,进一步对 84个水稻品种进行鉴定。统计分析后发现 ,Z336与最大根长的相关系数为 - 0 .193,相关性几近显著水平 ;与根干重的相关系数为 - 0 .391,相关性达极显著水平 ,计算对根干重的差异解释率 ,可达 15 .3% ,显示该标记与控制根干重性状表达的某个数量基因紧密连锁 ,它的存在对性状值的降低有显著的关系。进一步利用源于ZYQ8和JX17的加倍单倍体 (doublehaploid,DH)分离群体进行基因定位 ,发现Z336位于水稻第 11号染色体上 ,距离相邻的分子标记 9.4cM。