基于分子对接的副溶血弧菌外膜蛋白OmpW天然抑制剂的筛选

摘要

为了筛选更加高效、无毒、绿色的副溶血弧菌抑制剂,以副溶血弧菌外膜蛋白OmpW作为受体,利用分子对接方法筛选具有潜在抑菌作用的天然小分子,选用对接结果较理想的柠檬酸和咖啡酸进行试验验证。在测定最小抑菌浓度的基础上,研究去外膜和去壁的副溶血弧菌对小分子敏感性及杀菌曲线的变化,分析外膜蛋白OmpW是否为柠檬酸和咖啡酸的作用位点,验证基于分子对接筛选细菌抑制剂方法的正确性。研究结果显示,柠檬酸与咖啡酸对副溶血弧菌ATCC17802的最小抑制浓度均为2 mg/mL。去外膜和去壁的菌体与对照相比,最小抑制浓度减小16~64倍,这表明柠檬酸和咖啡酸很有可能作用于副溶血弧菌的外膜蛋白OmpW,分子对接结果也显示二者通过非共价结合发挥抑制作用。验证性试验表明:这两种小分子对于副溶血弧菌其它菌株类型也有同样的抑制效果。结论:柠檬酸和咖啡酸是有效的副溶血弧菌抑制剂(最小抑制浓度<5 mg/mL),其作用位点很可能是外膜蛋白OmpW。利用分子对接方法寻找高效、绿色的细菌抑制剂具有广阔的发展前景。