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高密度Oligo基因芯片筛选小鼠嗅球发育相关基因的研究

             

摘要

目的 研究小鼠嗅球发育相关基因表达谱,探讨嗅球(olfactorybulb ,OB)在室管膜前下区(anteriorsubventricularzone ,SVZa)神经干细胞的迁移及分化中的作用。方法 采用165 0 0点的小鼠高密度Oligo基因芯片对胚胎16d(embryonicday16,E16)、生后1d(postnatalday 1,P1)、7d(P7)、2 1d(P2 1)OB的基因表达情况进行检测,以4个时相点全脑等量混合样品作为对照。结果 通过筛选基因表达谱,得到5 2 77条在E16、P1、P7及P2 1OB中均有表达的基因,然后采用两两对比组合,得到6组数据,从中筛选出了5 81个差异在3倍以上的基因,分层聚类分析将其分为6大类,进一步分析了与SVZa区神经干细胞的迁移相关基因Slit2聚类同组的2 8个基因及与多巴胺神经元分化相关基因TH聚类同组的17个基因。结论 在小鼠嗅球发育中发现了5 81条表达差异≥3倍的基因,进一步通过对与Slit2相关的2 8个基因及与TH相关的17个基因的分析有助于揭示SVZa神经干细胞迁移及向多巴胺神经元分化的作用机制。

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