大林姬鼠中汉坦病毒的分离及其S片段的序列分析

摘要

目的分析吉林省大林姬鼠携带的汉坦病毒(HV)在进化过程中的系统发生关系。方法采用病毒分离技术、逆转录聚合酶链反应(RT PCR)、克隆以及测序技术对中国大林姬鼠携带的HV进行研究。结果从4只大林姬鼠HV抗原阳性的肺组织标本中分离到2株HV(CJI89和CJI93),对其中CJI93病毒株的S片段进行克隆、测序以及分析,基因分型结果为汉滩型(HTN)汉坦病毒。根据S片段的核苷酸序列同源性分析,CJI93与Aa2499核苷酸序列的同源性最高(94.3%),而与Ap61、Ap63的同源性最小(83.3%,82.9%)。由全S片段构建的HTN型汉坦病毒的系统发生树表明CJI93与Aa2499等俄罗斯黑线姬鼠携带的HV的亲缘关系最近,其次为中国的HTN型病毒,然后才是Ap61、Ap63等俄罗斯大林姬鼠携带的HV。结论从我国吉林省大林姬鼠分离到的CJI93株是HTN型汉坦病毒的新亚型。