长春市麻疹病毒流行株M和N基因特征分析

摘要

目的：了解2005～2006年长春市麻疹病毒的优势基因型及其核蛋白（N）、基质蛋白（M）基因序列特征。方法：采集2005～2006年长春市暴发和散发麻疹临床病例标本,使用WHO推荐的Vero/SLAM细胞进行麻疹病毒分离。用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增麻疹病毒分离株的核蛋白（N）基因羧基端450个核苷酸片段和基质蛋白（M）基因的188个核苷酸片段。对扩增产物的核苷酸序列进行测定和分析。结果：共分离到11株麻疹病毒野毒株。经对分离株的核蛋白（N）碳末端450个核苷酸进行序列测定和亲缘性关系比较,N基因与H1基因型代表株相比同源性为98.0%～98.4%,和其它已知麻疹病毒的22个基因代表株相比,长春市麻疹毒株在核苷酸水平上最大变异为10.9%。M基因的144 bp中,流行株均有4～11核苷酸不同于疫苗株Changchun-47,其中只有06 JL-1毒株的2个碱基突变有意义,引起氨基酸的改变。结论：2005年和2006年流行株的核酸序列有所不同,每个年份内流行株相同,而两年流行株之间有所差别,但是属于H1基因型。说明长春市近年来麻疹的流行株仍然是H1基因型。