浙江省麻疹病毒流行株血凝素基因的变异及其与国内外流行株的差异

摘要

目的探讨浙江省麻疹病毒（measles virus,MV）流行株血凝素基因的变异情况,及其与国内外流行株的差异。方法选取浙江省1999—2011年分离保存的麻疹病毒流行株33株,提取病毒核酸,采用RT-PCR法扩增其血凝素（H）基因全序列,并与GenBank上下载的中国麻疹疫苗株沪191,以及95株国内外各基因型麻疹毒株的H基因序列进行比较分析。结果从浙江省1999—2011年麻疹患者咽拭子标本中分离麻疹病毒株33株,与1993—2007年我国其他地区麻疹流行株构建H基因系统进化树,结果表明33株浙江麻疹流行株均属于Hla亚型,流行株分布无明显时间和地域特征。以疫苗株沪191为参考株,我国2003—2011年H1a亚型流行株H基因的核苷酸、氨基酸平均变异率以及进化率分别为5.15%、4.44%和5.81%,分别高于1965—1993年（4.75%、3.86%和5.30%）,以及1994—2002年（4.80%、4.08%和5.37%）流行株平均变异率与进化率;3个时间段流行株H基因非同义替换率与同义替换率的比值（cdn/ds）分别为0.19、0.21和0.23,表明1993—2011年我国Hla型麻疹流行株尚未受到明显的正向选择作用。我国2003—2011年Hla亚型毒株与沪191之间,在H基因上共存在24个稳定的氨基酸变异位点;Hla亚型流行株与A基因型疫苗株间差异最大,遗传距离为0.053,氨基酸差异数为26～28个,而B3、D4型代表株与沪191间稳定的氨基酸差异仅为15个。另外,Hla型流行株与B、D基因型毒株间差异明显,组间遗传距离分别为0.074和0.071,氨基酸差异数达27～33个。结论麻疹病毒Hla亚型流行株与疫苗株以及其他基因型麻疹病毒株,在H基因上存在明显差异,且该差异随时间累积而增大,应该引起足够的重视。