72株大肠埃希菌参考菌株的基因组分型及种系发育关系

摘要

目的通过两种分子生物学分型方法对72株分离自不同地域不同宿主的大肠埃希菌进行分型以及种系进化研究,并比较两种方法的差异。方法利用72株大肠埃希菌的7个持家基因序列进行多位点序列分型;培养大肠埃希菌,用I-CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后,根据酶切图谱的异同进行脉冲场凝胶电泳分型。结果这些菌株根据多位点序列分型可以分为49个型,而通过I-CeuI酶切条带差异可以分为68个型,二者有一定程度的重叠。结论脉冲场凝胶电泳分型的分辨率更高,并且72株大肠埃希菌的基因序列以及基因组结构都存在多样性。