基于pcox1基因分析黑斑蛙小吻对盲囊线虫种系发育关系

摘要

以湖南省不同地区黑斑蛙体内采集的16条小吻对盲囊线虫样品为研究对象,利用PCR对其线粒体DNA中的细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行扩增,分析其遗传变异情况.并利用软件Clustal X 2.0对其序列进行分析,探讨小吻对盲囊线虫与其他线虫的种群遗传关系.测序结果显示,所获得的pcox1序列长度一致,均为400 bp,湖南省各分离株之间相应序列的相似性在97％以上,与GenBank中登录的其他小吻对盲囊线虫pcox1序列的相似度均低于89％.结果表明,小吻对盲囊线虫pcox1序列种内相对保守,种间差异较大,可以作为种间遗传变异研究的分子标记,从而为小吻对盲囊线虫的分子流行病学调查研究等奠定基础.