水稻纹枯病菌谷氨酸合成酶RsGLT1基因的克隆及生物信息学分析

摘要

谷氨酸是生物体内重要的氨基酸，谷氨酸的体内平衡对维持生物的正常生长和代谢非常重要。同时，谷氨酸的稳态也影响病原真菌对宿主的附着、侵染等过程，是其致病力的重要影响因子。谷氨酸合成酶，是谷氨酸合成途径中的重要影响因子。为了对水稻纹枯病菌中的GLT1基因编码蛋白进行结构和分子功能分析，本研究从水稻纹枯病菌中克隆获得了一个谷氨酸合成酶相关基因RsGLT1 （NADPH-dependent glutamate synthase, GLT1），并运用多种在线生物信息学分析工具，对该基因的同源性、理化性质、亲/疏水性、信号肽、功能域等进行了分析。结果显示，RsGLT1基因CDS长6 471 bp，编码2 156个氨基酸；该基因具有典型的GltB和GltD两个结构域，是一个非跨膜的亲水蛋白，不具有信号肽结构。本研究为研究水稻纹枯病菌谷氨酸合成调控途径及RsGLT1基因对水稻纹枯病菌致病力的影响奠定了理论基础。