椰子GA代谢途径相关基因的生物信息学分析

摘要

赤霉素（GAs）对植物生长发育具有重要的调控作用，本研究通过生物信息学方法对椰子GA代谢途径通路上有关基因的理化性质以及组织特异性表达进行分析，筛选出GA代谢相关基因45个，并对其结构、功能进行了预测。通过亚细胞定位分析发现，椰子GA代谢通路基因存在于细胞核、线粒体，且有功能蛋白翻译，这与GA代谢通路上相关蛋白的调控功能吻合。通过表达量数据分析发现在椰子不同组织中GA代谢相关基因的表达量存在差异，其中CnDELLA家族、CnGID1受体家族、CnFbox、CnSPY家族成员基因在胚、胚乳和胚愈伤组织中表达，表明其与幼苗期的生长发育有关，在椰子早期发育过程中可能存在DELLA蛋白的抑制作用。椰子GA代谢途径通路上相关基因研究对海南本地高、矮种育种的研究具有重要意义，通过对GA代谢途径通路上相关基因对比分析，为之后的研究提供理论支持。