基于多数据库分析FAM107A在胃癌中的表达及临床意义

摘要

目的研究FAM107A在胃癌组织中的表达情况,分析其表达差异与临床病理特征及预后之间的关系,并进一步探讨FAM107A在胃癌中的突变位点及相互作用蛋白情况。方法从Human Protein Atlas(HPA)数据库、TCGA数据库、Oncomine数据库中对FAM107A进行数据挖掘,分析FAM107A在正常组织和胃癌组织中的表达情况;运用LinkedOmics数据库分析FAM107A表达量与胃癌临床病理特征的关系;运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FAM107A表达量于胃癌患者预后的关系;运用cBioportal数据库、String数据库分析FAM107A在胃癌中的突变位点及相互作用蛋白情况。结果HPA数据库结果显示,正常组织中,FAM107A在大脑皮层表达量最高,在胃组织中表达量排第40位;肿瘤组织中,FAM107A在神经胶质瘤中表达量最高,胃癌中表达量处于第9位。且FAM107A蛋白主要定位在细胞核。Oncomine数据库中结果显示,170项有关FAM107A表达差异的研究具有统计学意义(P均0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库生存分析提示,FAM107表达差异与患者预后无统计学意义(P>0.05)。cBioportal数据库分析发现,FAM107A在胃癌中的突变只有错义突变一种类型(E140K)。与FAM107A相互作用的蛋白包括ETNPPL、SLCO1C1、GPHA2、TADA2A、SPARCL1等,并可能共同参与细胞过程。结论FAM107A在多种癌症中呈现低表达,包括胃癌。FAM107A蛋白主要定位于细胞核,且FAM107A在胃癌中的突变只有错义突变一种类型。FAM107A低表达与胃癌某些临床病理特征相关,与胃癌患者总体生存率无显著相关性。