基于多数据库分析FAM83C在胃癌中的表达及临床意义

摘要

目的胃癌的发生发展机制尚不明确。文中探讨FAM83C在胃癌组织中的表达情况,分析其表达差异与临床病理特征及预后的关系,并进一步探讨FAM83C在胃癌中的突变位点及甲基化情况。方法从TCGA数据库、Oncomine数据库中对FAM83C进行数据挖掘,分析FAM83C在胃癌及其他多类癌种中的表达情况;运用LinkedOmics数据库分析FAM83C表达量与胃癌临床病例特征的关系;运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FAM83C表达量与胃癌患者预后关系;运用cBioportal数据库、MethHC数据库分析FAM83C在胃癌中的突变位点及甲基化情况;运用String数据库分析与FAM83C相互作用的蛋白网络。结果Oncomine数据库中56项有关FAM83C表达差异的研究具有统计学意义(P<0.05),其中46项研究提示FAM83C在多种癌组织中高表达,且FAM83C在胃癌中的高表达具有统计学意义(P=0.000733)。同时,分析TCGA数据库中637个胃癌样本,结果显示FAM83C在各种组织类型的胃癌中均呈现高表达(P<0.05)。FAM83C表达量与患者年龄(P=0.0344)、T分期(P=0.034)的差异具有统计学意义(P<0.05)。FAM83C高表达组生存时间更短,预后更差,差异具有统计学意义(P=0.0071)。FAM83C在胃癌中的突变包括错义突变、框移突变、剪接突变3种类型。胃癌中FAM83C基因启动子区甲基化水平较正常胃组织显著升高(P<0.005)。与FAM83C相互作用的蛋白包括SLCO5A1、AKR7A3、MMP24、EIF6、ARL11等,并可能共同参与细胞功能过程。结论FAM83C在胃癌中呈现高表达;且FAM83C表达水平与胃癌恶性程度及不良预后具有一定相关性,在一定程度上表现为癌基因的特性,有望成为胃癌临床诊疗的新靶点。