人多形性腺瘤中与cyclin D1共表达LncRNA的初步筛选及鉴定

摘要

目的:在人多形性腺瘤中筛选出与差异表达基因细胞周期蛋白D1 (cyclin D1)表达相关的长链非编码RNA(LncRNA),并进行初步验证。方法:利用实时定量PCR、Western免疫印迹及基因芯片等方法,验证人多形性腺瘤组织中cyclin D1的表达,通过计算Pearson相关系数,筛选出与cyclin D1共表达的LncRNA。随机挑选其中的3个LncRNA(GSE61474TCONS00180431、ENST00000603829和T253381),利用实时荧光定量PCR鉴定其在人多形性腺瘤组织中的表达是否存在差异。采用SPSS19.0软件包对数据进行统计学分析。结果:Cyclin D1在人多形性腺瘤中的表达显著增高(P<0.05),共筛选出与cyclin D1共表达的9个LncRNA,其中上调6个,下调3个。实时荧光定量PCR结果显示,所挑选的3个LncRNA在肿瘤组织中的表达趋势与基因芯片结果一致,但后续扩大样本验证结果显示,仅ENST00000603829的表达差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:本研究成功筛选及验证人多形性腺瘤中cyclin D1相关LncRNA,提示这些LncRNA可能与cyclin D1相互作用从而在人多形性腺瘤的发生、发展中起到重要的调节作用。