云南地区2006～2009年狂犬病毒分离株P和M基因分子进化分析

摘要

2006-2009年自云南曲靖（YNQJ07、YNQJ08）、昭通（YNZT07、YNZT09）、楚雄（YNMD06）、保山（YNTC06）、红河（YNHH09）、怒江（YNNJ08）分离获得8株狂犬病毒,对其P和M基因进行克隆、测序,并与已知国内外代表毒株进行比对及系统发育分析。结果：云南狂犬病毒P基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为84.8%-99.4%和90.6%-99.3%;M基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为88.7%-99.5%和94.3%-100%;它们均属于基因Ⅰ型毒株,存在2个进化亚组群（Ⅰ、Ⅲ）;YNTC06与泰国和YN0601H、YN0701H毒株遗传关系密切,属于亚组群Ⅲ毒株;其余地州分离毒株均属于亚组群Ⅰ毒株,进一步可划分为2个不同进化亚分支,YNMD06属于分支Ⅰ,与近年江苏、安徽毒株遗传关系密切;分支Ⅱ包括YNQJ07、YNZT07、YNQJ08、YNNJ08、YNZT09、YNHH09,与湖南、贵州毒株遗传关系密切。亚组群Ⅰ毒株已成为当前我国狂犬病流行的优势毒株,亚组群Ⅰ的第Ⅱ分支毒株在云南省广泛分布。