长链非编码RNA在不同受孕能力精子中差异表达的初步分析

摘要

目的:通过对两组不同受孕能力的精子差异长链非编码RNA(lnc RNA)的分析,寻找与受孕能力相关的lnc RNA,探讨其在受精过程中可能的作用。方法:各取5份高、低受孕力的精液标本,提取大RNA,建c DNA库并测序。应用生物信息学方法,组装并预测lnc RNA。采取NOIseq方法筛选两组间有差异表达的lnc RNA,绘制箱图和火山图;运用Cluster软件进行表达模式聚类分析。采用基因本体(GO)及Pathway分析差异表达的lnc RNA功能分布,利用lnc RNA-mRNA互作分析和上下游顺式作用元件的交集分析,来预测lnc RNA的功能。结果:预测到471 615个lnc RNA,其中新lnc RNA 463 596个,已知lnc RNA 8 019个。差异表达分析结果显示,有4 052个lnc RNA存在显著差异,其中上调的985个,下调的3 067个。箱图和火山图显示出两组间存在明显的差异,表达模式聚类分析显示出两组间存在明显的差异。GO功能分类注释得出,差异表达的lnc RNA主要参与新陈代谢、生物调节、细胞膜及细胞器形成、蛋白核酸结合等; Pathway分析显示,差异表达的lnc RNA主要与运输分解代谢、细胞运动、信号分子相互作用、信号转导、以及发育和免疫系统信号通路等有关。5个lnc RNA的预测功能表明,它们可能与受精过程中的精子运动、顶体反应、信号转导相关。结论:差异表达的lnc RNA可能在受精过程中有重要作用,可能成为评估精子质量的生物标志物。