肺栓塞患者中差异表达的长链非编码RNA的筛选及分析研究

摘要

目的筛选肺栓塞(pulmonary embolism,PE)患者中差异表达的长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)。方法收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1月-2019年12月PE患者,4例为PE组,另取4例健康体检者为对照组。分别抽取两组外周静脉血5ml,测定血液中的IncRNA表达,采用Illumina高通量测序技术及bcl2fastq软件测定血液中的IncRNA表达,采用limma包/DESeq包和StringTie软件/PrepDE. Py技术分析PE与健康人群外周静脉血中lncRNA的差异。结果与对照组比较,PE组MERGE.25018.15,ERGE.30895.15,MERGE.32169.24,MERGE.30939.2,MERGE. 22370.6, MERGE. 32217.13, MERGE. 9106.11, MERGE. 7438.3, MERGE. 30701.47,MERGE. 6007.5升高;MERGE. 27071.1, MERGE. 14825.18, MERGE. 30701.1, MERGE. 20578.5;MERGE. 32241.2;MERGE. 15426.3;MERGE. 10320.15;MERGE. 2905.16, MERGE. 22859.26,MERGE. 28441.11降低,差异有统计学意义(P<0.05)。差异倍数最大的上调lncRNA为MERGE.25018.15差异倍数最大的下调IncRNA为MERGE.27071.1。差异表达的lncRNA靶基因在GO生物学途径方面主要涉及呼吸系统的发育、血管内皮细胞迁移的正调节作用等。KEGG信号通路富集分析主要涉及VEGF信号通路、癌症中的胆碱代谢、HIF-1信号通路、MAPK信号通路、Wnt信号通路、mTOR信号通路、非小细胞肺癌相关信号通路。结论 PE患者在lncRNA中调控呼吸系统的发育、血管内皮细胞迁移的正调控、血管内皮的生成、低氧状态、恶性肿瘤等方面与健康人群存在差异。