二穗短柄草SPL家族基因的鉴定、系统发育和表达分析

摘要

植物特异性SPL家族基因编码SBP(squamosa promoter-binding protein-like)保守结构,参与调节植物的生长和发育。为了解二穗短柄草中SPL家族基因的分布、结构及功能,对二穗短柄草全基因组中SPL家族成员进行了系统分析。结果表明,在二穗短柄草全基因组中鉴定出17个BdSPL[KG-1.0mm]基因,在5条染色体上呈不均匀分布,bd03号染色体上分布最多;根据系统发育树,17个BdSPL[KG-1.0mm]被分为6个组,同组成员有保守的结构和基序;其中6对BdSPL[KG-1.0mm]基因发生基因复制事件;在BdSPL[KG-1.0mm]基因启动子区域发现了各种顺式元件,如ABRE、CGTAC-motif和LTR。转录组数据和qRT-PCR分析显示,BdSPL[KG-1.0mm]基因在二穗短柄草花中表达量较高,而在根系中表达量较低,在不同植物激素处理下表达量有差异。