二穗短柄草BURP家族基因的鉴定与分析

摘要

BURP是一类植物特有蛋白，在生长发育和逆境防御中起着重要作用。为给后续的基因克隆、表达和功能验证奠定基础，根据二穗短柄草的基因组和蛋白质序列，利用生物信息学手段对BURP基因家族成员进行鉴定、染色体定位、序列分析和系统发育研究。结果表明，二穗短柄草有12个Bu品P基因，位于1～4号染色体上，在5号染色体上未见分布；BURP基因的全长为621～3350bp，具0～3个内含子，编码区全长621～2316bp，编码206～771个氨基酸，推导蛋白的等电点为5．02～9．51；12个BURP基因编码的蛋白分为5组，分别定名为RD22、PG1β、BURP—V、BURP—VI和BURP—VII，没有usP和BNM2类型的BuRP蛋白；此外，根据4个半胱氨酸一组氨酸重复所闻隔的氨基酸数量，二穗短柄草的BURP蛋白结构域可用CH／R—X10-CH—X25—36-CH—X22—25-CH—X8-W／F表示。