亚洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息学及其同源基因在陆地棉中的表达分析

摘要

多药和有毒化合物排出(MATE)蛋白家族是1个次级转运蛋白家族.为了更好地了解亚洲棉和雷蒙德氏棉中MATE蛋白的种类和数量,利用2种二倍体棉花基因组的氨基酸和cDNA数据库对MATE基因家族进行筛选,并分析亚洲棉和雷蒙德氏棉全基因组中MATE基因的种类和进化关系.结果显示,在亚洲棉基因组中初步鉴定了34个MATE基因,而在雷蒙德氏棉中筛选出42个MATE基因.基因结构和系统进化的比较分析表明,进化关系近的MATE基因在结构上基本是一致的.同时对陆地棉中克隆的GhTT12及与其同一族的部分MATE基因进行荧光定量分析,推测其所在同一族的MATE基因功能可能与转运原花青素有关.这些结果为进一步深入分析棉花MATE基因的功能以及在原花青素转运中的作用提供了理论基础.