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血清circRNA在PTMC及中央区颈部淋巴结转移的表达研究

         

摘要

目的 探讨血清环状RNA(circRNA)在甲状腺微小乳头状癌(PTMC)发生颈部淋巴结转移的表达水平.方法 选择2018年11-12月在新疆医科大学第一附属医院甲状腺外科手术经病理诊断为PTMC不伴颈部淋巴结转移(PTMC组)和PTMC伴颈部淋巴结转移[PTMC(L)组]的患者各6例,均为女性.收集两组患者的静脉血,随机选取每组3例患者进行芯片检测,每组剩余3例进行芯片结果验证.经基因本体(Go)软件检测两组患者血清中差异表达circRNA的亲本基因分析,得出富集前10位的生物学过程、细胞组分和分子功能.通过KEGG Pathway分析差异表达基因富集前10位通路.采用miRNA结合位点预测软件对hsa_cir-cRNA_000121 miRNA结合位点进行预测.结果 经芯片检测PTMC与PTMC(L)组患者中血清筛选差异表达circRNA共有690个,其中上调400个,下调290个.采用miRNA结合位点预测软件对hsa_circRNA_000121预测到的5个具有高匹配值的miRNA结合位点,MRE1、MRE2、MRE3、MRE4、MRE5分别为hsa-miR-NA-6775-3p、hsa-miRNA-146b-3p、hsa-miRNA-3614-3p、hsa-miRNA-3139、hsa-miRNA-3064-5p.逆转录PCR(RT-PCR)对circRNA000121结果验证表明,芯片结果和验证结果一致;与PTMC组比较,PTMC(L)组患者hsa_cir-cRNA_000121表达水平上调3.24倍(3.24±0.38 vs.1.01±0.15),差异有统计学意义(P<0.01).结论 cir-cRNA000121在女性、PTMC并中央区淋巴结转移的血清中高表达,后期需要进一步扩大样本量进行验证.

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