220株结核分枝杆菌北京临床分离株的基因分型研究

摘要

目的 了解结核分枝杆菌北京临床分离株的基因分型种类和特征,为结核病防治研究提供基础科学依据.评价两种分型方法 在北京地区结核病分子流行病学中的应用.方法 收集北京市结核分枝杆菌临床分离株,应用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)二种分型方法进行基因分型,结果 聚类分析采用BioNumerics(Version 5.0)软件.结果 共在北京地区收集到220株结核分枝杆菌临床分离株.采用Spoligotyping分型方法,220株菌可分为2个基因群,即北京家族(Beijing family)和非北京家族(non-Beijing family),20种基因型.其中北京家族含有202株菌,占91.82%.北京家族菌株中,典型北京家族菌株占95.05%(192/202),非典型北京家族占4.95%(10/202).北京家族菌株的耐药率为22.55%(22/98),非北京家族菌株的耐药率为16.67%(1/6),两者间的差异无统计学意义(fisher analysis,P=0.5835>0.05).采用MLVA分型方法,202株菌可分成5个基因群59种基因型,主要为Beijing family、China2 和China3,分别占91.37%、2.73%和4.55%.结论 北京地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,其主要流行型为北京家族.北京家族菌株与耐药性无明显相关性.