早发家族性阿尔茨海默病患者线粒体基因组变异分析

摘要

目的 探索线粒体DNA (mitochondrial DNA,mtDNA)变异与早发家族性阿尔茨海默病发病风险的相关性.方法 从2014年3月至2020年4月收集到的早发家族性阿尔茨海默病家系样本中筛选出4个具有母系遗传特征的阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)家系样本,开展mtDNA全序列测序,与修正版的剑桥参考序列比对分析.测序结果根据标准序列记录下每个样本的mtDNA变异位点及相关信息.采用最新版的mtDNA分类系统数据库进行线粒体单倍型类群分类.变异分析方法:根据系统发育树,找出枝端私有变异位点;MitoTool分析变异的保守性;再通过PhyloTree查询突变是否为其他单倍型类群的鉴定变异.通过文献和数据库查询,SIFT致病性预测软件(2015)预测分析.通过Ⅰ-TASSER预测蛋白结构,Pymol可视化蛋白结构同源模拟蛋白三级结构分析,分析结构变化.结果 其中一个家系的mtDNA存在稀有非同义变异m.8978T＞C,该位点保守系数1.0,致病性分数较高,蛋白结构同源模拟MT-ATP6蛋白三级结构分析,显示该蛋白支链残端的结构改变.结论 mtDNA稀有非同义变异m.8978T＞C可能具有潜在的致病性,可能通过线粒体的功能下降影响AD的发病.