马立克氏病病毒'814'疫苗株基因组重复区序列测定及分析

摘要

为了解马立克氏病病毒(MDV)强、弱毒株主要致肿瘤相关基因变异情况,本研究根据MDV GA株基因组序列,设计合成扩增基因组重复区的引物,得到MDV 814疫苗株病毒基因组中约26 kb的序列片段.与GenBank登录的强、弱毒株进行比较分析表明,扩增的MDV1型814疫苗株的长重复区为12 774 bp,预测的开放阅读框(ORF)有48个;短重复区为11 426 bp,预测的ORF有38个.发现了4个MDV 814株特有的ORF.814株在编码Meq、RLORF6和23 ku的重叠基因内具有类似于疫苗株CVI988的177 bp的插入;在RLORF12基因编码区内存在69 bp的缺失,该缺失位于病毒复制起始位点内.同时,发现7个814疫苗株特有的氨基酸突变,分布在6个ORF内.单核苷酸多态性(SNP)的鉴定发现,多个基因具有单核苷酸的突变,主要分布于Meq基因,其中氨基酸A115V(丙氨酸-缬氨酸),N142D(天冬酰胺-天门冬氨酸)的变异是814疫苗株所特有的.MDV 814疫苗株重复区的基因序列的比较分析将有助于MDV致肿瘤机制的研究.