郑州市男同性恋中HIV-1 gp41基因亚型分析

摘要

目的了解郑州市男同性恋人群HIV-1流行株的亚型分布情况。方法于2011年3—4月采集郑州市30例男同性恋HIV-1感染者的血样,应用逆转录及巢式PCR方法扩增HIV-1gp41基因并进行测序,应用BioEdit软件对序列进行校对编辑,应用美国洛斯阿拉莫斯国家实验室HTV核酸序列库和美国国立生物技术信息中心提供的在线分析工具进行比对分析,确定其基因亚型,应用MEGA3.1软件构建系统进化树,并对不同亚型gp41基因扩增区的基因离散率进行分析。结果在30例男同性恋HIV-1感染者的血样中,共获得18个HIV-1 gp41基因序列,分别为CRF15-01B[50%（9/18）亚型、CRF01-AE亚型[22%（4/18）、CRF07-BC亚型22%（4/18）]和B亚型6%（1/18）]。各亚型毒株均与各自的参考株聚集,CRF15-01 B、CRF01-AE、CRF07-BC亚型的组内基因离散率分别为0.050±0.007、0.052±0.009和0.082±0.012。结论郑州市男同性恋人群HIV-1流行株亚型分布较复杂,重组型毒株已成为优势流行株。