全基因组表达谱芯片在新疆维汉族胶质母细胞瘤患者中的应用研究

摘要

目的：运用基因表达谱芯片，筛选有意义的新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤的差异表达基因，从而探讨差异基因在新疆维、汉族患者胶质母细胞瘤发病机制及预后转归中的作用及临床意义。方法运用全基因组表达谱芯片检测3例维族患者胶质母细胞瘤、3例汉族患者胶质母细胞瘤的基因表达情况，并通过GenomeStudio软件，R语言lumi包进行标准化处理筛选差异表达基因（P＜0.05）；运用Web Gestalt软件，对差异基因做GO生物信息学分析（P＜0.05）。结果维、汉族患者胶质母细胞瘤全基因组表达谱的比较分析发现，筛选出显著差异表达的基因共1475个，上调669个，下调807个（其中1个基因（STRC）对应2个转录本，1个转录本表达上调1个转录本表达下调），差异基因中通过GO分析有1175个关键基因分布在小G T P酶调节信号通路、Ras信号通路、神经元反应蛋白调节、中枢神经系统髓鞘形成等多个生物学过程的功能节点中。结论通过对维、汉族患者胶质母细胞瘤基因表达谱的研究，筛选出差异表达的相关基因，并对其功能及定位信息进一步分析，从多基因相互作用的角度探究胶质母细胞瘤发生发展分子机制及维、汉族胶质母细胞瘤的发病机制差异性。