基于高通量测序分析晚期肺癌患者肺部微生物多样性

摘要

背景 与目的肺部微生物组与肺部疾病的发生密切相关,微生物可从多方面促进肿瘤的发生与发展.既往研究证实肺癌患者肺部微生物组较健康人发生了变化,但关于不同类型肺癌患者中肺部微生物组的微生物组成尚未明确.本研究旨在探讨不同组织学类型肺癌间的微生物组相关性及差异性.方法 采用Illumina HiSeq高通量测序技术对晚期肺癌患者痰样本进行细菌V3-V4区的16S rDNA测序及生物信息学分析.结果 经物种分类分析发现肺癌患者痰样本中以链球菌属、奈瑟氏菌属、普雷沃氏菌属为主.腺癌(adenocarcinoma,AD)组以链球菌属及奈瑟氏菌属为主,小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)组以奈瑟氏菌属为主,鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)组以链球菌属为主,混合型小细胞肺癌(combined small cell lung cancer,C-SCLC)组以链球菌属为主.结论 不同组织学类型肺癌的肺部细菌微生物组结构及组成存在差异性,不同组织学类型肺癌间优势菌群有所不同,本研究丰富了肺癌肺部细菌微生物组学数据.