兰格湖裸鲤肌肉生长抑制素基因(MSTN)的克隆及生物信息学分析

摘要

cqvip:2017年7月-2018年5月,用三层刺网(网目5cm)在西藏自治区日喀则市昂仁县浪措(29°12’33.45’’N,87°23’5.46’’E)(又名兰格湖)近岸水域采集兰格湖裸鲤Gymnocypris chui 15尾,克隆转化生长因子-beta(TGF-β)超家族中的重要成员-肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因,用生物信息学分析兰格湖裸鲤MSTN基因结构组成以及种间的遗传分化。研究结果表明,与其他脊椎动物相似,兰格湖裸鲤MSTN结构由3个外显子和2个内含子组成,序列全长3 526bp,碱基组成为A(29.6%);C(21.7%);G(20.6%);T(28.1%)。氨基酸同源性分析表明,MSTN基因在大多脊椎动物中编码375个氨基酸,但是,MSTN基因在物种间存在一定的分化。系统发育分析表明,MSTN基因编码区序列高度保守,裂腹鱼亚科鱼类相似性达到99.8%,而与哺乳动物序列相似性较低,这与生物进化分类结果相一致。本研究结果可为开展兰格湖裸鲤的遗传学和保护生物学研究奠定基础。