广西狂犬病病毒野毒株的分子流行病学分析

摘要

目的测定广西不同地区,不同时间分离的狂犬病病毒野毒株的基因型.方法选用8株广西毒株和1株安徽株和10株国外株狂犬病病毒提取mRNA,作逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,用377自动测序仪读取,N蛋白基因序列区间为1 157-1 467(320 bp).序列分析采用pile up和pretty程序作碱基配对和比较分析,种系发生采用phylip软件包.结果广西8株狂犬病病毒呈现地域性分布,同一地区之间核苷酸序列同源性差异小于2%,而二地区间差异在15%以上;广西株与美国、南非、墨西哥毒株截然不同.8株广西株可归属与A组的A1(广西柳州地区株)、A2 a(玉林地区株)和A2 b(广西宁明株)三个基因组,其中广西10 chb株与泰国的二株Thbkrb 2123、Thdg 2933株同属A2 b组,但广西株与属B组的美国、墨西哥、南非毒株不同.结论广西至少存在3个基因型,存在有不同来源的病毒株.