河北省鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析

摘要

目的了解河北省肾综合征出血热（HFRS）疫源地宿主动物所携带汉坦病毒的基因型和基因亚型。方法根据76-118株和R22株的保守序列设计型特异性引物,用RT-nested PCR从IFA筛选的阳性鼠肺中扩增部分M片段,经琼脂糖凝胶电泳进行基因分型,并从中选取部分扩增产物纯化回收后进行核苷酸序列测定,用DNAStar软件包进行基因分析。结果32份经IFA筛选阳性的鼠肺标本经RT-nested PCR扩增出418bp特异性目的片段,均为SEO型。10份扩增产物测序结果表明G2片段变异不大,同源性高达98.0%～100%,与R22株和76-118株的同源性分别为93.3%～94.3%和67.7%～69.0%。结论依据G2片段,河北省HFRS疫源地汉坦病毒基因型以SEO型病毒为主,主要为S3亚型,同亚型病毒基因高度同源,遗传物质相对稳定。不同鼠种可携带同亚型汉坦病毒。