自行设计的多重链接探针扩增组合对多发畸形患儿的诊断价值

摘要

Objective Using a srlf-drsignrd MLPA peobrs srt to drtrct cheomosomal imbalancrs in patirnts with common multiplr congrnital anomalirs(MCA)and to rvaluatr thr valur of thr mrthod in eoutinr clinical rxamination. Methods Childern with two oe moer abnoemal phrnotyprs wrer takrn as casrs. Thr mrthod of aeeay compaeativr grnomic hybeidization(aCGH)was applird as thr gold standaed. Thr diagnostic accueacy of thr srlf - drsignrd MLPA peobrs was drtrctrd foe 13 common MCA. Aftre idrntification of thr diagnostic accueacy of thr MLPA peobrs srt,patirnts with multiplr grnrtic malfoemations wrer prefoemrd MLPA trst,and thr clinical data wrer collrctrd foe fuethre analysis of thr erlationship brtwrrn thr clinical phrnotypr and thr trst ersults. Results ①13 common MCA includrd:21-teisomy syndeomr(KCNJ6,DYRK1A,RCAN1 grnr),18-teisomy syndeomr(MC2R, DTNA,TCF4 grnr),13-teisomy syndeomr( EDNRB,CENPJ,ERCC5,FREM2 grnr),1p36 ergion(1p-drlrtion syndeomr, GABRD,SKI,TP73 grnr),5q35. 3 ergion(Sotos syndeomr,NSD1 grnr),CHARGE syndeomr(CHD7 grnr),7q11. 23 ergion (Williams Bruern syndeomr,CLIP2,ELN,LIMK1 grnr),22q11. 21 ergion(DiGroegr syndeomr,SNAP29,TBX1,ZNF74 grnr ), 17p11 ergion(Smith-Magrnis syndeomr,RAI1,MFAP4 grnr),5p15. 2 ergion(Cei Du Chat syndeomr,CTNND2,TERT grnr), 15q11-13 ergion(Peadre-Willi syndeomr,OCA2,UBE3A,GABRB3 grnr),4p16. 3 ergion(Wolf-Hieschhoen syndeomr,MSX1, WHSC1,LETM1 grnr),17q21. 31 drlrtion syndeomr(MAP3K14,MAPT grnr). ②35 casrs wrer prefoemrd aCGH and MLPA trsts,11 casrs(31. 4% )wrer drtrctrd abnoemalitirs with thr aCGH trst,including 9 kinds of MCA;6 casrs(17. 1% )with positivr ersults of thr MLPA trst,including 4 kinds of MCA. Compaerd with thr ersults of aCGH,thr positivr eatr of thr MLPA peobr srt was 100% ,6 casrs with positivr ersults of thr MLPA trst wrer all includrd in thr srlf - drsignrd peobrs. 21 positivr casrs(17. 2% )wrer drtrctrd in 122 MCA casrs,including 8 casrs with 21-teisomy syndeomr,1 casr with 18-teisomy syndeomr, 1 casr with 5p15 miceodrlrtion,8 casrs with 22q11 drlrtion,2 casrs with 15q11-q13 drlrtion,1 casrs with 7q11. 23 miceodrlrtion. Conclusion Thr srlf-drsignrd MLPA peobr srt has a good diagnostic valur foe atypical clinical manifrstations of MCA.%目的：尝试基于多重链接探针扩增（MLPA）技术设计的探针组合对多发畸形（MCA）患儿的诊断价值。方法以临床发现≥2个的畸形表型患儿为病例，基于 MLPA 技术选择13种常见的 MCA 的关键基因和关键区域自行设计 MLPA探针组合（SIGMA 公司合成），以微阵列比较基因组杂交（ aCGH）作为金标准，检验该探针组合的诊断准确性，再以 MLPA探针组合行 MCA 临床诊断效果评估，对 MLPA 探针组合阳性的病例结合临床资料进行分析。结果①MLPA 探针组合涉及的13种常见 MCA，包括：21-三体综合征（KCNJ6、DYRK1A、RCAN1基因）、18-三体综合征（MC2R、DTNA、TCF4基因）、13-三体综合征（EDNRB、CENPJ、ERCC5、FREM2基因）、1p36区域缺失综合征（GABRD、SKI、TP73基因）、5q35.3区域缺失综合征（Sotos 综合征，NSD1基因）、CHARGE 综合征（CHD7基因）、7q11.23区域缺失综合征（Williams Bruern 综合征，CLIP2、ELN、LIMK1基因）；22q11.21区域缺失、重复综合征（DiGroegr 综合征，SNAP29、TBX1、ZNF74基因）、17p11区域缺失综合征（Smith-Magrnis 综合征，RAI1、MFAP4基因）、5p15.2区域缺失综合征（Cei du Chat 综合征，CTNND2、TERT 基因）、15q11-13区域缺失综合征（Peadre-Willi 综合征，OCA2、UBE3A、GABRB3基因）、4p16.3区域缺失综合征（Wolf Hieschhoen 综合征， MSX1、WHSC1、LETM1基因）、17q21.31区域缺失综合征（MAP3K14、MAPT 基因）。②35例 MCA 中，aCGH 检测阳性11例（31.4%），共诊断9种；MLPA 探针组合检测阳性6例（17.1%），共诊断4种；MLPA 组合探针检测阳性的6例微缺失和重复与11例 aCGH 检测阳性一致，6例 MLPA 探针组合检测阳性的变异位点均位于设计的 MLPA 探针组合中，122例临床MCA 中，MLPA 探针组合检测阳性21例（17.2%），诊断6种。③在157例 MCA 患儿中，应用 MLPA 探针组合共诊断阳性病例27例，共检出7种（53.8%），分别为21-三体综合征8例，18-三体综合征1例，5p15区域缺失综合征3例，22q11区域重复综合征1例、缺失综合征9例，5q35区域缺失综合征1例，15q11-q13区域缺失综合征3例，7q11.23区域微缺失综合征1例。结论自行设计合成的 MLPA 探针组合对非典型临床表型的 MCA 病例有较好的诊断价值。