小核仁RNA宿主基因4在胃癌中的预后价值及潜在作用机制

摘要

目的旨在探讨小核仁RNA宿主基因4（SNHG4）在胃癌组织中的表达、预后价值及可能作用机制。方法运用UALCAN数据库分析SNHG4在胃癌中的表达情况;Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNHG4与胃癌预后的关系;StarBase、Targetscan、microT-CDS数据库及Cytoscape软件构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络;DAVID数据库对SNHG4相关miRNA的靶基因进行生物学功能及通路分析。结果 SNHG4在胃癌组织中的表达明显高于正常组织（P=8.882E-16）。生存分析发现SNHG4高表达的胃癌患者总体生存时间少于低表达组（P=8.900E-05）。通过RNA调控网络的构建, 发现在胃癌中hsa-let-7a-5p（P=1.02E-03）、hsa-miR-152-3p（P=4.51E-06）、hsa-miR-204-5p（P=6.68E-04）和hsa-miR-363-3p（P=8.06E-03）可作为SNHG4的结合位点。SNHG4作用于这4种miRNA进一步调控250个靶基因。对靶基因的GO注释及KEGG富集分析, 发现这些靶基因在蛋白质磷酸化的调节、转录负调控、RNA聚合酶II启动子的转录等生物过程中发挥作用, 且通过阻断或激活Wnt等信号通路参与胃癌的发生及发展。结论 SNHG4可作为胃癌潜在的诊断性肿瘤标志物, 判断胃癌预后情况, 通过构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络, 从分子水平研究胃癌的发病机制, 为实验研究及临床研究提供明确方向。