系统性红斑狼疮患者血中微小RNA和mRNA表达情况及相互作用的生物信息学分析

摘要

目的对系统性红斑狼疮(SLE)血中的微小核糖核酸(miRNA)和信使RNA(mRNA)相关的基因表达谱进行综合的生物信息学分析。方法拟定检索策略,从数据库中下载与SLE相关的基因表达谱,通过软件/数据库进行差异基因筛选、miRNA靶基因预测、miRNA靶基因与mRNA取交集基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集、蛋白-蛋白互作网络和miRNA-mRNA互作网络。结果共纳入3个数据集,miRNA靶基因与mRNA有720个交集基因,且这些基因富集到CXC趋化因子活性、B细胞分化等重要的功能,以及经典的Wnt、Toll样受体等通路;分析得出蛋白-蛋白和miRNA-mRNA相互作用网络。结论miRNA可能通过直接靶向作用调控靶基因,进而影响SLE患者体内多种基因及信号通路的网络调控,从而参与SLE疾病的发生和发展。