乳酸乳球菌NZ9000基因组规模代谢网络模型的构建与验证

摘要

随着后基因组时代的到来,工业微生物的代谢工程改造在工业生产上发挥着越来越重要的作用.而基因组规模代谢网络模型(Genome-scale metabolic model,GSMM)将生物体体内所有已知代谢信息进行整合,为全局理解生物体的代谢状态、理性指导代谢工程改造提供了最佳的平台.乳酸乳球菌NZ9000 (Lactococcus lactis NZ9000)作为工业发酵领域的重要菌株之一,由于其遗传背景清晰且几乎不分泌蛋白,是基因工程改造和外源蛋白表达的理想模式菌株.文中基于基因组功能注释和比较基因组学构建了L.lactis NZ9000的首个基因组规模代谢网络模型iWK557,包含557个基因、668个代谢物、840个反应,并进一步在定性和定量两个层次验证了iWK557的准确性,以期为理性指导L.lactis NZ9000代谢工程改造提供良好工具.