包装饮用水中铜绿假单胞菌4种鉴定方法的比较

摘要

为了比较铜绿假单胞菌4种鉴定方法对检测结果的一致性和准确性,笔者采用GB 8538.57—2016、VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定系统、API 20E肠杆菌和其他革兰氏阴性杆菌鉴定系统、16S rRNA基因序列分析法,对包装饮用水样品中分离到的25株野生型菌株进行复核验证,最终结果以16S rRNA基因序列测序分析为参考.结果显示API 20E鉴定结果与16S rRNA基因序列比对结果一致,GB 8538.57—2016与VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定系统方法均存在假阳性.经测序比对分析,发现假阳性菌株与铜绿假单胞菌的序列差异主要集中在16S rRNA的可变区,BLAST程序同源性比较和系统发育分析确认其为同属的恶臭假单胞菌和荧光假单胞菌.GB 8538.57—2016检验结果有1株假阳性菌株,比例为7.14％,VITEK 2 Compact鉴定结果有6株假阳性菌株,比例为31.58％.由此可见GB 8538.57—2016、VITEK 2 Compact、API 20E和16S rRNA基因序列分析法对铜绿假单胞菌的鉴定需要互相结合,互为佐证,提高准确性.