金黄色葡萄球菌肠毒素A成熟肽基因序列的克隆及抗原性分析

摘要

目的 扩增金黄色葡萄球菌 (金葡菌)肠毒素A(SEA)基因并对其进行抗原性分析,为后续抗原性弱化及安全性免疫毒素的构建提供依据.方法 以金葡菌基因组DNA为模板,以SEA编码基因特异区段为引物,采用Touchdown PCR克隆SEA成熟肽编码基因,经菌落PCR筛选出阳性克隆后再进行DNA测序及BL2SEQ比对分析,并应用生物信息学软件对所得基因编码蛋白各区段的抗原性进行分析.结果PCR产物克隆后,菌落PCR挑选得到阳性克隆,DNA测序后进行的BL2SEQ比对显示,所得序列与GenBank中登录的序列之间一致性达100%.SEA成熟肽各区段上的抗原性均值较高,同时,有几个突出高值点分布在不同的区段上.结论 应用特定的生物信息学方法 从理论上确定了SEA成熟肽的高抗原性位点,为后续弱化SEA的抗原性研究提供了依据.