大白母猪乳头数全基因组关联分析

摘要

乳头数是评价母猪繁殖性能的重要参数,是大白猪选种的重要指标之一。本研究利用1118头大白猪母猪群体,利用50K SNP芯片对该群体进行基因分型,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS)及Fst选择信号分析,筛选该群体的左乳头数、右乳头数和总乳头数性状相关基因。结果显示:GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的遗传力分别为0.062、0.006、0.047。GEMMA软件共检测到10个达到染色体显著水平(P0.12);SSC7上检测的41个显著SNPs中有40个位于已报道的乳头数相关QTLs中。2、7、16号染色体显著SNPs位点上下游1 Mb区域内共包含63个基因。其中,GABRG2、GABRA1、PRDM6、HSD17B4、HSD17B11、GABRB2、FAM170A、RAD51B为乳头数强相关基因。研究检测到显著区间可作为分子标记用于大白母猪乳头数的选育。