伊犁马毛色性状的全基因组关联分析

摘要

实验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘影响伊犁马毛色性状的关键基因,探究马毛色性状的遗传基础.本研究基于670K高密度芯片,利用卡方检验对129匹伊犁马的毛色性状进行关联分析,探索影响毛色性状的相关基因.利用Plink1.9软件对个体和SNP位点进行质控,质控后剩余119个个体和494137个单苷酸多态性位点(SNP)用于后续关联分析.通过基因组水平的Bonferroni校正,发现位于3号染色体上的2个SNP与毛色性状显著关联(P<5.19E-7),39个基因被注释出,经检索后发现MC1R基因与毛色性状有关.