三红蜜柚、琯溪蜜柚与水晶香柚的基因组序列多态性分析

摘要

三红蜜柚和琯溪蜜柚均是梅州市蜜柚主产区大面积种植的品种,三红蜜柚是琯溪蜜柚2次芽变后选育得到的优良品种,水晶香柚是三红蜜柚芽变后选育出的新品种。目前对3个品种之间的遗传相似性的认识仅限于表型性状描述和经验为主,为进一步挖掘3者的亲缘关系和遗传多样性信息,对三红蜜柚、琯溪蜜柚、水晶香柚进行了全基因组测序(总数据量30×),系统地比较了3个品种单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失(InDel)、结构变异(SV)、品种拷贝数变异(CNV)序列差异。对3个品种的农艺性状进行了比较,在全基因组水平解析其遗传差异,为今后柚子育种改良中更好地利用三红蜜柚、琯溪蜜柚和水晶香柚提供了重要遗传信息。